Måndag 11 augusti 2014.- En internationell undersökning med spanska deltagande identifierar en mekanism genom vilken hundratals mutationer introduceras i lung- och kolorektala tumörer.
Transduktion av sekvenser i DNA är ett litet känt fenomen och anses sällan. Dess huvudperson är 50% av genomet som kallas parasitiskt DNA, bildat av element som ibland replikerar sig och migrerar till andra platser i den genetiska sekvensen.
"Vi har observerat att en specifik typ av sekvenstransduktion relaterad till ett område i genomet som heter LINE-1 är ganska ofta, särskilt i lung- och koloncancergener, " säger José Tubío, forskare vid Wellcome Trust Sanger Institute of Cambridge och första undertecknare av artikeln, som publiceras i tidskriften Science.
Tillsammans med honom, och som en del av en stor internationell grupp forskare, har fyra andra spanska forskare i Cambridge deltagit i arbetet: Marta Tojo, Íñigo Martincorena, Jorge Zamora och Pablo Román.
För att nå denna slutsats utvecklade forskarna en algoritm som identifierar och lokaliserar ursprunget och de nya platserna för de mobila LINE-1-elementen.
"Att veta vilka transponerbara element i vårt genom har aktivitet i tumörer och var de gömmer öppnar dörrarna för utformningen av läkemedel som tystar den mutagena aktiviteten hos dessa 74 element i cancer, utan att behöva använda bredspektrala läkemedel som kan påverka andra. regioner i genomet, säger Román, en av medförfattarna till arbetet och för närvarande forskare vid HUCA i ben- och mineralmetabolism.
Å andra sidan, "fann vi att det fanns epigenetiska förändringar förknippade med migrationen av transponerbara element. Med tanke på att epigenetiska förändringar är nära besläktade med miljön, pekar detta arbete på ett nytt sätt att förhålla mellan genomet och hur vi äter och andas.", säger Roman.
Med orden från Tubio, "kommer det att vara nödvändigt att göra fler studier för att besvara de frågor som ställs av denna forskning om de funktionella konsekvenserna av den mekanism vi har observerat, men det är ingen tvekan om att detta fynd ger ett nytt perspektiv av intresse för diagnos och behandling. cancerläkare. "
Källa:
Taggar:
Nyheter Regeneration Hälsa
Transduktion av sekvenser i DNA är ett litet känt fenomen och anses sällan. Dess huvudperson är 50% av genomet som kallas parasitiskt DNA, bildat av element som ibland replikerar sig och migrerar till andra platser i den genetiska sekvensen.
"Vi har observerat att en specifik typ av sekvenstransduktion relaterad till ett område i genomet som heter LINE-1 är ganska ofta, särskilt i lung- och koloncancergener, " säger José Tubío, forskare vid Wellcome Trust Sanger Institute of Cambridge och första undertecknare av artikeln, som publiceras i tidskriften Science.
Tillsammans med honom, och som en del av en stor internationell grupp forskare, har fyra andra spanska forskare i Cambridge deltagit i arbetet: Marta Tojo, Íñigo Martincorena, Jorge Zamora och Pablo Román.
Plats för de mest aktiva elementen
Forskarna analyserade rörligheten för LINE-1-element i 300 genom av 12 olika typer av cancer och observerade att endast 74 av de 500 000 transponerbara elementen av typ LINE-1 som finns i humant DNA kan förflytta sig i cancergener .För att nå denna slutsats utvecklade forskarna en algoritm som identifierar och lokaliserar ursprunget och de nya platserna för de mobila LINE-1-elementen.
"Att veta vilka transponerbara element i vårt genom har aktivitet i tumörer och var de gömmer öppnar dörrarna för utformningen av läkemedel som tystar den mutagena aktiviteten hos dessa 74 element i cancer, utan att behöva använda bredspektrala läkemedel som kan påverka andra. regioner i genomet, säger Román, en av medförfattarna till arbetet och för närvarande forskare vid HUCA i ben- och mineralmetabolism.
Mobilisering av kompletta gener
Som forskarna observerade involverar sekvensomvandlingen som härrör från aktiviteten av LINE-1-element ibland mobilisering av kompletta gener och deras överföring till andra regioner av DNA. Därför förändras strukturen, antalet gener och genomuttrycket.Å andra sidan, "fann vi att det fanns epigenetiska förändringar förknippade med migrationen av transponerbara element. Med tanke på att epigenetiska förändringar är nära besläktade med miljön, pekar detta arbete på ett nytt sätt att förhålla mellan genomet och hur vi äter och andas.", säger Roman.
Med orden från Tubio, "kommer det att vara nödvändigt att göra fler studier för att besvara de frågor som ställs av denna forskning om de funktionella konsekvenserna av den mekanism vi har observerat, men det är ingen tvekan om att detta fynd ger ett nytt perspektiv av intresse för diagnos och behandling. cancerläkare. "
Källa:
